
构建的shRNA真核表达来自载体或者mirshRNA真核表达载体,由于载体上均带有LR同源重组臂,所以这些载体均可作为YRBIO腺病毒包装系统中的穿梭载360百科体使用。如果目的细胞质粒转染效率较低,则可直接以这些载体为基础包装腺世色粮铁独足案象病毒,利用腺病毒感染目的细胞。
- 中文名 shRNA真核表达载体构建
- 缺 点 载体上没有荧光标记。
- 优 点 可以选择构建一条或者多条
- 别 称 mirshRNA真核表达载体
基本简介
YRBIO-shRNA表达系来自统
作为RNA干扰实验的第错消许还一步,靶位点的选择,以及相应的shRNA表达载体构建,是整个RNA干扰实验的重中之重。靶位点选择恰当,shRNA干当形环慢草扰效率高,整个RNA干角据福害逐扰实验就能够事半功倍,否则,就会做许多无用功。
shRNA表达载体构建后均可作为YRBIO腺病毒包装系统洲阻行其烧孩中的穿梭载体使用。如果目的细胞质粒转染效率较低,则可直接以这些载体为基础包装腺病毒,利用腺病毒感染目的细胞。
有许多免费软件或网站能360百科够提供靶位点选择及shRNA序列设计,但是这种免费软件算法落后,设计出的shRNA序列有效率只有25%~3查孔0%左右。与之相对应的,是一些商态各制关笔针当业化软件,或者现成的商业化shRNA库,由于其算法先进,设计原则合素妈足样怀余食谁略似理,其提供的shRNA序列的有效率通常能达到75%以上,亦即可以达到每四条shRNA有三条有效。
基于以上,YRBIO系统在国内率先引进代表RNA干扰领域全球顶尖水准的TRC(The RNAi,RNA干扰协会)开发的TRC shRNA库。该库针对人、小鼠、大鼠等数万升简止西容径面财个基因,每个基因旧高数整最找成础移误提供3~5条shRNA已手(已构建至载体上),总数达五万多条,且数量还在不断增加。经过大规模实验验证,其中超过75%均为有效shRNA,其干扰效率均大于70%(大多数超过80%)。

以此shRNA库为基础跑入方例味晚增山架古空,针对每个基因,可提供3~5条高质量的shRNA序列,并且构建到除组几shRNA真核表达载体上。由于此数据库中族下适机的shRNA序列有效性超过75%,亦即理论上来说,每一套shRNA克隆中,必定至少有一条shRNA的干扰效率超过70%。右图为携带绿色荧光的shRNA真核表达载体pYr-1.1-hU6-EGFP质粒图谱 (attL1和attL2为腺病毒重组位点)。
只需事先了解需要干扰的目的基因混州香好价含答明露最,我们就会为您从伟演温继攻依采数据库中调取相应的shRNA序列信息,然后,您可以选择合适的sh合向RNA表达系统来表达shRNA,进行RNA干扰实验。
选择需要干扰的目的基因,从数据库中调取相应的shRNA序列信息,然后,选择合适的shRNA表达系统来表达shRNA。
YRBIO系统提供的shRNA真核表达载体,共有hU6、mU6稳诉律假七接杆仅钟、hH1、h7SK等四种polIII型启动子可供选择,可选择携带荧光(包括绿色荧光、红色荧光)或不携带荧光。除此之外,还时鱼头职书提供mirshRNA真核表达载体,可以进行mirshRNA真核表达载体构建。
利用腺病毒的高感染效率、高表达效率,更好地进行RNA干扰研究实验!
既可以用来当普通的shRNA真核表达载体用,同时又是穿梭载体,可以拿来包装腺病毒,而且其干扰有效性、干扰效率大部分都超过 80%!
选用YRBIO-shRNA表达系统,具有如下优点:

(1)shRNA序列数据依然来自国外成熟shRNA数据库,质量有保证。RNA干扰效率的高低主要取决于靶位点的选择、shRNA序列的设计,而由于YRBIO所采用的shRNA序列来自国外成熟shRNA数据库,算法先进,靶位点成功率高,所以shRNA的干扰成功率非常高。
(2)您可以选择构建一条或者多条,灵活度高。
(3)多种启动子,有荧光或无荧光,绿色荧光或红色荧光等可自由选择,以更好地配合后续实验。
(4)载体可作为普通shRNA表达载体使用,亦可作为腺病毒包装系统的穿梭载体使用,以进行腺病毒包装。
右图为不携带荧光的shRNA真核表达载体pYr-2.1-hU6质粒图谱(attL1和attL2为腺病毒重组位点)。
表达系统
此shRNA数据库亦有一套原装进口的shRNA表达系统相匹配,针对每个基因的一套shRNA序列均已构建至相应的shRNA表达载体上,可直接使用,整套产品均为原装进口。
此系统中,装载shRNA序列的真核表达载体,同时也是YRBIO第三代慢病毒包装系统中的穿梭载体。也就是说,如果目的细胞质粒转染效率较低,那么只需相应的慢病毒包装系统中的包装质粒、转染试剂、293T包装细胞,便可以将这些shRNA包装慢病毒,利用慢病毒的高感染效率、高表达效率、长期表达特性,更好地进行RNA干扰研究实验!
右图为shRNA真核表达载体pYrbio-LT-1质粒图谱

选用原装进口shRNA表达系统,具有:
优点:
(1)原装进口产品,未做任何改动。
(2)装载shRNA序列的真核表达载体,同时也是慢病毒包装系统中的穿梭载体,可用以包装慢病毒。
缺点:
(1)载体上没有荧光标记。
(2)载体骨架稍微有点大,有7K左右。
TRC库
TRC(The RNAi,RNA干扰联盟)是由麻省理工学院和Harvard牵头建立的合作机构,包括Massachusetts General Hospital、Harvard Med school、Dana Farbe封敌识危责死毛r Cancer Inst、The Broad Institute、Whitehead Institute、MIT、Academica Sinica (Taiwan)和另外5个国际性组织,代表着RNA干扰领域的全球最顶尖水平。该组织计划在3年内构建数量达15,000个人类基因和15,000个小鼠基因的shRNA文库。第1版来自的TRC shRNA文库包括35,000 shRNA克隆(其中人类基因有5300个,小鼠基因有2200个),其它新构建的克隆每个季度会陆续公布。
评论留言